Получение возмещения НДС в виде облигаций осуществляется на добровольных началах. Для этого налогоплательщику необходимо подать в орган Миндоходов заявление об оформлении возмещения НДС облигациями внутреннего государственного займа.

Органы Миндоходов передают органам казначейства реестры плательщиков с заключениями о суммах возмещения НДС. После этого органы казначейства в 5-дневный срок выдают плательщикам облигации внутреннего государственного займа. При этом оформление облигаций приравнивается к получению налогоплательщиком бюджетного возмещения путем перечисления средств с бюджетного счета на счет плательщика НДС.